Session interne de Sète (6,7,8 juin 2011)

Réunion de travail Mexico

Sète

6-8 juin 2011

Lieu

Ifremer,

Station de Sète (Accès)

ifremer, Sète

 

 

Programme

Pariticipants

Résumé de ces journées

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Programme

 

Début :

Lundi, 6 juin 11h

 

Fin :

Mercredi 8 juin 16h30

 

 

 

 

 

 

Lundi

 

 

 

 

 

11h00

12h30

Session Collective : introduction et point sur les projets

 

 

 

40mn

Introduction : informations et point sur les projets MEXICO en cours

 

 

 

 

 

- Séminaires 2011 (Indicateurs) et 2012 (Incertitudes?)

 

 

 

 

 

- École chercheurs 2012

 

 

 

 

 

- Projets ANR

 

 

 

 

20mn

Point manuel (TD : liens avec la BAO)

 

 

 

 

30mn

Point BAO

 

 

 

 

 

 

 

 

- Point MTK

10mn (description de l'existant)

HR

 

 

 

 

- Point MED

10mn (description de l'interface)

Nejdi

 

12h30

14h00

Repas

 

 

 

 

 

14h00

17h30

Sessions par groupe (Manuel & BAO)

 

 

Groupe Manuel

 

 

 

- Présentation des chapitres par leur auteur et discussion

 

 

 

 

- Discussion générale (articulation, TD ...)

 

 

 

Groupe BAO

 

 

 

Description de MED

 

Nejdi

 

 

 

- Diagramme de classe

 

 

 

 

 

- MVC

 

 

 

 

 

- Choix techniques

 

 

 

 

 

- Démo de ce qui est fonctionnel

 

 

 

 

 

- Discussions

 

 

 

 

Récapitulatif détaillé de MTK

 

 

 

 

 

- Présentation de MTK (Introduction, Conception et Achitecture)

 

HR

 

 

 

-  Utilisation de MTK à  travers deux exemples:

 

 

 

 

 

 

- utilisation à partit d'un fichier de spécification XML

 

(Juhui)

 

 

 

 

- utilisation au sein d'une session R

 

(HR)

 

 

 

- Discussions

 

 

 

 

 

 

 

 

- Implémentation des tests

(?)

 

 

 

 

- Production de reporting

(?)

 

 

 

 

- Sérialisation des objets

(?)

 

 

 

 

- Interface et intégration d'extension de nouvelles méthodes développées sous R

(?)

 

 

 

- TP MTK

 

(?)

 

 

 

Installer les outils, le code et tester MTK

 

 

 

 

 

Bilan, discussions, construction du programme de mardi

 

Mardi

 

 

 

 

 

 

 

8h30

12h30

 Sessions par groupe (Manuel & BAO)

 

 

 

 

- Suite des travaux par groupes

 

 

 

 

- Préparation d'une synthèse à présenter en plénière

 

 

12h30

14h00 

Repas

 

 

 

 

 

14h00

16h00

Restitution collective des travaux par groupe

 

 

 

 

- Groupe Manuel (accent sur les TP)

 

 

 

 

 

- Groupe BAO (présentations des questions et ajustements)

(HR?)

 

16h30

17h30

Discussion générale sur l'avenir du réseau MEXICO

 

 

 

 

 

- Projets et organisation

- Copyright et Convention

 

 

 

 

 

- Autres points

 

Mercredi

 

 

 

 

 

 

 

8h30

12h30

Sessions par équipe (libre, en fonction de l'avancement des travaux)

 

 

Ex :

- Séance TP : un statisticien implémente une méthode dans la BAO

 

 

 

 

- Détail des TD de l'école chercheurs 2012 (lien avec le manuel)

 

 

 

 

 

 

 

     

Participants

Mode Transport

Arrivée

Départ

Robert

Faivre

 Voiture

(Toulouse)

 Lundi matin

 Mercredi après-midi (?)

Hervé

Monod

 Train

(Paris-Sète)

 Lundi 10h57

 Mercredi 17h49

Juhui

Wang

 Train

(Paris-Sète)

 Lundi 12h12

 Mercredi 14h57

Hervé

Richard

 Voiture

(Avignon)

 Lundi matin

 Mercredi 16h30

Claude

Bruchou

 idem

idem

 idem

 Mercredi après-midi (?)

Nejdi

El Arbi

 Voiture

idem

 idem

 Mercredi après-midi (?)

Éric

Ramat

 Train

(Calais-Sète)

 Lundi matin

 Mercredi 13h12

David

Makowski

 A: Train

 R: Avion

(Paris-Sète)

(de Montpellier)

 Lundi 10h57

 

 Mardi 18h00

Bertrand

Iooss

 Avion

+ loc.voiture

 Lundi matin

 Mardi matin (très tôt)

Stéphanie

Mahevas

 Avion

+voiture JCS

 Lundi 7h50 Montpellier

 Mardi soir 20h50 Montpelleier

Benjamin

Poussin

 idem

idem

 idem

 idem

Thierry

Faure

 Train

(Clermont-Sète)

 Lundi soir

 Mercredi 15h43

Jean-Christophe

Soulié

 Voiture

(Montpellier)

 Lundi matin

 Mercredi (?)

Lauriane

Rouan

 idem

idem

 idem

 Mercredi (?)

Compte rendu des journées internes du réseau MEXICO à Sète

Discussion générale sur le positionnement du réseau

  1. MEXICO est un réseau d'application-enseignement-formation plutôt que réseau méthodologique : les personnes présentes partagent à peu près ce constat, au moins en termes de visibilité, et émettent l'intérêt d'identifier des thèmes méthodologiques à creuser en commun.

    Il faudra également développer les encadrements de thèse sur les thèmes du réseau.

  2. positionnement de MEXICO vis-à-vis du GDR Mascot-Num (en profitant de la présence de B. Iooss) :

    Il y a complémentarité entre les deux réseaux plutôt que concurrence : MascotNum est sur un positionnement plus méthodologique avec un public majoritairement statisticien. Il faut identifier et développer les synergies entre le groupe Environnement du GDR et MEXICO (avec déjà des projets communs, exemple Ecole-Chercheur 2013).

Prochain événement

Séminiare :

thème « Incertitudes »

lieu RP

organisateur : T. Faure (avec l'aide S.Mahévas)

Restitution des groupes de travail

groupe « MANUEL »

intitulé : Analyse de sensibilité et exploration de modèles, Applications aux modèles environnementaux

  • réorganisation de la structure du livre. Voir la demande formulée aux éditions QUAE :

  • Demande d'édition

  • CV et publis des coordinateurs sur le thème

  • Résumé et plan de l'ouvrage

  • ajout du chapitre 9 : Boîte à Outils pour l’exploration de modèle – application à un modèle dynamique de population de mauvaises herbes (Hervé Richard, Juhui Wang, Benjamin Poussin, Jean-Christophe Soulié, Éric Ramat, Jean Couteau, Nicolas Dumoulin, David Makowski, 40p)

    => le groupe BAO doit rapidement fournir un plan de chapitre détaillé avec une répartition des charges de rédaction (coordonnateur David).

     

    L'ossature du chapitre peut être la suivante :

    • présentation de la BAO

      • Objectif,

      • Public visé

    • Concept détaillé

    • Exemple à partir des TP EC avec le modèle WEEDS

 

Calendrier Prévisionnel

    • Décembre 2010 → Version complète

    • mars 2012 → soumission de l'ouvrage

    • juin 2012   → École Chercheurs MEXICO adossée à l'ouvrage

                             → Soumission du manuscrit aux éditions QAE

    • décembre 2013 → publication

groupe « BAO »

La structure d'ensemble prend forme et dispose des possibilités d'introduire  des méthodes statistiques par tiers.
 

Rappel du schéma général (Benjamin)

principe BAO MEXICO

 

  • Simulateur ou plateforme de simulation

  • autres: par exemple une méthode R lit des fichiers CSV pour en faire un dataframe décrivant les facteurs

  • MED: Mexico ÉDiteur

  • BAO: librairie MEXICO (mtk)

     

Étapes

  1. La plateforme ou un autre outil génèrent l'ensemble du modèle ainsi que l'ensemble des facteurs pour lesquels le modèle est conçu (fichier XML Facteurs et const)

  2. L'éditeur MED permet d'aider l'utilisateur à définir les facteurs qui vont variés, la manière dont se fera la variation (en choisissant la loi du distribution qu'ils suivront)

    Ceci se fait soit à partir de ces spécifications des facteurs donnés par les plateformes, soit directement par création « manuelle ».

  3. L'utilisateur défini ensuite comment appeler le simulateur et comment analyser les résultats (génération du fichier XML Facteurs + workflow)

  4. La BAO génère l'ensemble des runs (fichier XML / run) et les envoie au simulateur qui retourne les résultats.

  5. Lorsque tous les runs ont été effectués, la BAO analyse les résultats.

Proposition d'une démarche pour ajouter une nouvelle méthode

Le but de ce présentation était de montrer l'état d'avancement de la réflexion sur les moyens à mettre à disposition pour les statisticiens qui souhaitent introduire de nouvelles méthodes d'analyses des modèles.

Un débat s'en est suivi sur la façon de définir le lancement de simulateur au sein du fichier XML de spécification

  • soit selon la norme utilisée dans la communauté   XML (voir l'exemple de WEEDS)

  • soit via une syntaxe de type URI qui est connue de la communauté Web Services

    L'idée étant de garder à la fois la possibilité d'échanger avec des plateformes distantes et de faciliter les utilisations locales.

On a privilégié la première solution pour ne pas mélanger les métiers tout en retenant  la 2ème  comme solution de réalisation: un parser de la BAO lit le fichier XML correspondant et le convertir en URI lors de l'appel.

La matinée de mercredi a été consacrée à la réalisation d'un test en situation réelle : à partir d'une méthode codée par Robert, on a  montré comment l'intégrer dans la BAO.

Ce test a permis de valider le concept ainsi que d'identifier les parties que nous devrons encapsuler pour un maximum de transparence.

 

Présentation de MED (Nejdi)

L'objectif principal de MED est de fournir un moyen pratique aux utilisateurs qui souhaitent explorer leur modèle. Il permet de simplifier les spécifications des plans d'expérience à mettre en œuvre ainsi que les méthodes utilisées pour les analyses statistiques.

Par souci de commodité, les lois et méthodes sont prédéfinies dans l'outil (avec possibilité de mise à jour de la liste).

Pour construire cette liste nous nous appuierons sur l'outil développé par Thierry qui « fouille » R et extrait les noms des fonctions correspondantes aux lois dans un package R donné avec les paramètres nécessaires à leur appel.

 

premières réflexions sur le reporting

informations attendues :

  • données factuelle sur l'expérimentation

    • graine,

    • temps de calculs

  • Descriptions des facteurs

  • Descriptions des méthodes

  • analyses de base (~ summary, plot, ...)

 

l'ensemble de ces travaux ont permis de réactualiser une feuille de route concernant les objectifs techniques de la BAO.