Réunion de travail Mexico						Sète		6-8 juin 2011
Lieu	Ifremer, Station de Sète (Accès)
	Programme Pariticipants Résumé de ces journées
			Programme
Début :		Lundi, 6 juin 11h
Fin :		Mercredi 8 juin 16h30
Lundi
	11h00	12h30	Session Collective : introduction et point sur les projets
		40mn	Introduction : informations et point sur les projets MEXICO en cours
				- Séminaires 2011 (Indicateurs) et 2012 (Incertitudes?)
				- École chercheurs 2012
				- Projets ANR
		20mn	Point manuel (TD : liens avec la BAO)
		30mn	Point BAO
				- Point MTK	10mn (description de l'existant)				HR
				- Point MED	10mn (description de l'interface)				Nejdi
	12h30	14h00	Repas
	14h00	17h30	Sessions par groupe (Manuel & BAO)
	Groupe Manuel
		- Présentation des chapitres par leur auteur et discussion
		- Discussion générale (articulation, TD ...)
	Groupe BAO
		Description de MED							Nejdi
			- Diagramme de classe
			- MVC
			- Choix techniques
			- Démo de ce qui est fonctionnel
			- Discussions
		Récapitulatif détaillé de MTK
			- Présentation de MTK (Introduction, Conception et Achitecture)						HR
			-  Utilisation de MTK à  travers deux exemples:
				- utilisation à partit d'un fichier de spécification XML					(Juhui)
				- utilisation au sein d'une session R					(HR)
			- Discussions
				- Implémentation des tests					(?)
				- Production de reporting					(?)
				- Sérialisation des objets					(?)
				- Interface et intégration d'extension de nouvelles méthodes développées sous R					(?)
			- TP MTK						(?)
			– Installer les outils, le code et tester MTK
			– Bilan, discussions, construction du programme de mardi
Mardi
	8h30	12h30	Sessions par groupe (Manuel & BAO)
			- Suite des travaux par groupes
			- Préparation d'une synthèse à présenter en plénière
	12h30	14h00	Repas
	14h00	16h00	Restitution collective des travaux par groupe
			- Groupe Manuel (accent sur les TP)
			- Groupe BAO (présentations des questions et ajustements)						(HR?)
	16h30	17h30	Discussion générale sur l'avenir du réseau MEXICO
				- Projets et organisation - Copyright et Convention
				- Autres points
Mercredi
	8h30	12h30	Sessions par équipe (libre, en fonction de l'avancement des travaux)
		Ex :	- Séance TP : un statisticien implémente une méthode dans la BAO
			- Détail des TD de l'école chercheurs 2012 (lien avec le manuel)

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Participants		Mode Transport		Arrivée	Départ
Robert	Faivre	Voiture	(Toulouse)	Lundi matin	Mercredi après-midi (?)
Hervé	Monod	Train	(Paris-Sète)	Lundi 10h57	Mercredi 17h49
Juhui	Wang	Train	(Paris-Sète)	Lundi 12h12	Mercredi 14h57
Hervé	Richard	Voiture	(Avignon)	Lundi matin	Mercredi 16h30
Claude	Bruchou	idem	idem	idem	Mercredi après-midi (?)
Nejdi	El Arbi	Voiture	idem	idem	Mercredi après-midi (?)
Éric	Ramat	Train	(Calais-Sète)	Lundi matin	Mercredi 13h12
David	Makowski	A: Train  R: Avion	(Paris-Sète) (de Montpellier)	Lundi 10h57	Mardi 18h00
Bertrand	Iooss	Avion	+ loc.voiture	Lundi matin	Mardi matin (très tôt)
Stéphanie	Mahevas	Avion	+voiture JCS	Lundi 7h50 Montpellier	Mardi soir 20h50 Montpelleier
Benjamin	Poussin	idem	idem	idem	idem
Thierry	Faure	Train	(Clermont-Sète)	Lundi soir	Mercredi 15h43
Jean-Christophe	Soulié	Voiture	(Montpellier)	Lundi matin	Mercredi (?)
Lauriane	Rouan	idem	idem	idem	Mercredi (?)

Compte rendu des journées internes du réseau MEXICO à Sète

Discussion générale sur le positionnement du réseau

1. MEXICO est un réseau d'application-enseignement-formation plutôt que réseau méthodologique : les personnes présentes partagent à peu près ce constat, au moins en termes de visibilité, et émettent l'intérêt d'identifier des thèmes méthodologiques à creuser en commun.

   Il faudra également développer les encadrements de thèse sur les thèmes du réseau.

2. positionnement de MEXICO vis-à-vis du GDR Mascot-Num (en profitant de la présence de B. Iooss) :

   Il y a complémentarité entre les deux réseaux plutôt que concurrence : MascotNum est sur un positionnement plus méthodologique avec un public majoritairement statisticien. Il faut identifier et développer les synergies entre le groupe Environnement du GDR et MEXICO (avec déjà des projets communs, exemple Ecole-Chercheur 2013).

Prochain événement

Séminiare :

thème « Incertitudes »

lieu RP

organisateur : T. Faure (avec l'aide S.Mahévas)

Restitution des groupes de travail

groupe « MANUEL »

intitulé : Analyse de sensibilité et exploration de modèles, Applications aux modèles environnementaux

• réorganisation de la structure du livre. Voir la demande formulée aux éditions QUAE :

• Demande d'édition

• CV et publis des coordinateurs sur le thème

• Résumé et plan de l'ouvrage

• ajout du chapitre 9 : Boîte à Outils pour l’exploration de modèle – application à un modèle dynamique de population de mauvaises herbes (Hervé Richard, Juhui Wang, Benjamin Poussin, Jean-Christophe Soulié, Éric Ramat, Jean Couteau, Nicolas Dumoulin, David Makowski, 40p)

  => le groupe BAO doit rapidement fournir un plan de chapitre détaillé avec une répartition des charges de rédaction (coordonnateur David).

   

  L'ossature du chapitre peut être la suivante :

  • présentation de la BAO

    • Objectif,

    • Public visé

  • Concept détaillé

  • Exemple à partir des TP EC avec le modèle WEEDS

 

Calendrier Prévisionnel

• • Décembre 2010 → Version complète

  • mars 2012 → soumission de l'ouvrage

  • juin 2012   → École Chercheurs MEXICO adossée à l'ouvrage

                           → Soumission du manuscrit aux éditions QAE

  • décembre 2013 → publication

groupe « BAO »

La structure d'ensemble prend forme et dispose des possibilités d'introduire  des méthodes statistiques par tiers.
 

Rappel du schéma général (Benjamin)

 

• Simulateur ou plateforme de simulation

• autres: par exemple une méthode R lit des fichiers CSV pour en faire un dataframe décrivant les facteurs

• MED: Mexico ÉDiteur

• BAO: librairie MEXICO (mtk)

   

Étapes

1. La plateforme ou un autre outil génèrent l'ensemble du modèle ainsi que l'ensemble des facteurs pour lesquels le modèle est conçu (fichier XML Facteurs et const)

2. L'éditeur MED permet d'aider l'utilisateur à définir les facteurs qui vont variés, la manière dont se fera la variation (en choisissant la loi du distribution qu'ils suivront)

   Ceci se fait soit à partir de ces spécifications des facteurs donnés par les plateformes, soit directement par création « manuelle ».

3. L'utilisateur défini ensuite comment appeler le simulateur et comment analyser les résultats (génération du fichier XML Facteurs + workflow)

4. La BAO génère l'ensemble des runs (fichier XML / run) et les envoie au simulateur qui retourne les résultats.

5. Lorsque tous les runs ont été effectués, la BAO analyse les résultats.

Proposition d'une démarche pour ajouter une nouvelle méthode

Le but de ce présentation était de montrer l'état d'avancement de la réflexion sur les moyens à mettre à disposition pour les statisticiens qui souhaitent introduire de nouvelles méthodes d'analyses des modèles.

Un débat s'en est suivi sur la façon de définir le lancement de simulateur au sein du fichier XML de spécification

• soit selon la norme utilisée dans la communauté   XML (voir l'exemple de WEEDS)

• soit via une syntaxe de type URI qui est connue de la communauté Web Services

  L'idée étant de garder à la fois la possibilité d'échanger avec des plateformes distantes et de faciliter les utilisations locales.

On a privilégié la première solution pour ne pas mélanger les métiers tout en retenant  la 2ème  comme solution de réalisation: un parser de la BAO lit le fichier XML correspondant et le convertir en URI lors de l'appel.

La matinée de mercredi a été consacrée à la réalisation d'un test en situation réelle : à partir d'une méthode codée par Robert, on a  montré comment l'intégrer dans la BAO.

Ce test a permis de valider le concept ainsi que d'identifier les parties que nous devrons encapsuler pour un maximum de transparence.

 

Présentation de MED (Nejdi)

L'objectif principal de MED est de fournir un moyen pratique aux utilisateurs qui souhaitent explorer leur modèle. Il permet de simplifier les spécifications des plans d'expérience à mettre en œuvre ainsi que les méthodes utilisées pour les analyses statistiques.

Par souci de commodité, les lois et méthodes sont prédéfinies dans l'outil (avec possibilité de mise à jour de la liste).

Pour construire cette liste nous nous appuierons sur l'outil développé par Thierry qui « fouille » R et extrait les noms des fonctions correspondantes aux lois dans un package R donné avec les paramètres nécessaires à leur appel.

 

premières réflexions sur le reporting

informations attendues :

• données factuelle sur l'expérimentation

  • graine,

  • temps de calculs

  • …

• Descriptions des facteurs

• Descriptions des méthodes

• analyses de base (~ summary, plot, ...)

 

l'ensemble de ces travaux ont permis de réactualiser une feuille de route concernant les objectifs techniques de la BAO.